超声波清洗机已广泛应用于实验室，如萃取、清洗、乳化等。由于其高效率、高节能、高自动化等无可比拟的优势，被广泛应用于各行各业。
超声波清洗机采用超声波的空化效应原理，可以清洗物体表面的污垢，超声空化会使微小气泡的破裂产生巨大的压力，使细胞壁的破裂瞬间完成，缩短破碎时间，分离杂质达到萃取等目的。同时，超声波产生的振动增强了物质的释放、扩散和溶解，可显著提高提取率。与常规提取方法相比，超声波辅助提取技术具有提取效率高、提取时间短、能耗低等优点。
乳化是液体以极微小的状态分散在另一种不相容的液体中形成乳液的过程。实验室超声波清洗机中的乳化是利用超声空化和机械作用剪切大分子并使其均匀化，达到乳化效果。此外，超声波的作用还可以增加一些不溶于水的物质的活性，使其分散均匀或溶于水。
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